由于围产期或产后早期传播是慢性HBV感染最重要的来源，所有的婴儿（包括低出生体质量、早产婴儿）应该在出生后尽快接种第1剂乙型肝炎疫苗，最好在24 h内。如果不能实现在24 h内接种，24 h后再接种也有一定的效果。虽然在7 d之后有效性逐渐下降，仍然可以防止HBV感染，因此是有益的。

在出生剂量接种完成后，应继续接种第2剂或第3剂以完成初级接种程序。下列选项都被认为是合适的：（1）接种3剂乙型肝炎疫苗，第1剂在出生后24 h内，第2剂和第3剂的接种时间与白喉、百日咳、破伤风疫苗第1和第3剂量相同；或（2）接种4剂乙型肝炎疫苗，第1剂单价疫苗接种完成后继续接种3剂，额外的剂量不会造成任何伤害。每一剂应至少间隔4周。

在HBV中低流行的国家，未接种疫苗的个体可能患有急性和慢性HBV感染，其中许多可能是在出生疫苗及儿童疫苗普及之前的群体。对于强化疫苗，应优先考虑较年轻的年龄组，因为慢性感染的风险在这些群体中发生率最高。强化疫苗对于HBV的预防具有时效性，应根据现有的资源进行优先考虑。

乙型肝炎疫苗可交替用于免疫计划中。乙型肝炎疫苗和其他疫苗可在不同的解剖部位注射。在婴儿出生时乙型肝炎疫苗可以与髓灰质炎疫苗和卡介苗同时使用。